Seoste lisamine võimaldab luua linkide kaudu seoseid Amphora süsteemi hõlmatud dokumentide vahel. Kasutada saab seda näiteks olukorras, kus tahetakse ühendada mõned sama teemaga seotud dokumendid. Seda võimalust saab kasutada ka siis, kui teema kohta pole algatatud eraldi asja (Vaata asjade lisamine!), mis dokumendid koondaks ühte toimikusse.
Seoste lisamiseks toimida järgmiselt:
⇒ Liikuda vormil Dokumendid -> Laadimine (varem laaditud dokumendi muutmisel Dokumendid -> Muutmine) paneeli „Seosed“ juurde.
⇒ Seose lisamiseks vajutada paneelil olevat nuppu „Lisa“.
⇒ Avaneb vorm, kust saab lisada seoseid teiste süsteemis olevate objektidega.
⇒ Valida moodul, millega dokumenti seostada. Selleks vajutada välja Moodul taga olevale noolega nupule.
⇒ Pärast valiku tegemist kuvatakse valitud moodulis olevate kirjete loetelu.
⇒ Valida loetelust kirje, millega seost luua ning vajutada kirje pealkirjale.
⇒ Väljale Objekt ilmub valitud kirje pealkiri.
⇒ Seejärel vajutada nuppu „Tagasi“.
⇒ Seose salvestamiseks vajutada nuppu „Salvesta“.

Paneelil „Seosed“ on ka nupp „Uus paneel“. Üldiselt annab süsteem paneelidele nimed vastavalt sellele, millisest moodulist seostatav kirje valiti (kui dokumentide moodulist, siis saab paneeli nimeks Dokumendid, kui sõnumite moodulist, siis Sõnumid jne).
Kui on soov kirjutada paneelile oma nimi, saab seda teha:
⇒ Vajutades nuppu „Uus paneel“.

⇒ Kirjutada uue paneeli nimi ja vajaduse korral ka kommentaar.

⇒ Vajutada nuppu „Tagasi“. Eelnevalt lisatud seosed kuuluvad nüüd paneeli alla „Üldised seosed“, kuid neid saab liigutada uue paneeli alla vajutades noole peale.
⇒ Muudatuste salvestamiseks vajutada nuppu „Salvesta“.